Eine SCENAR-Behandlung dauert zwischen 5 - 15 min, je nach Notwendigkeit und Reaktion des Patienten. Dabei wird die erkrankte Körperregion vom Therapeuten mit dem SCENAR-Gerät bestrichen. Über die Reaktion der Haut oder über die vom Gerät angezeigten Messwerte kann der Behandler die für die Therapie erfolgsversprechendste Stelle ausfindig machen. Diese wird dann in der Therapiesitzung so lange behandelt, wie sich eine Verbesserung der dortigen Regulationsstörung zeigt (erkennbar an den gemessenen Werten für den Hautwiderstand). Nach jeder Behandlung sollte der Patient eine Veränderung seines Beschwerdebildes feststellen können.
Bei akuten Erkrankungen sind weniger (in der Regel 1-5), bei chronischen Beschwerden häufigere (5-15) Behandlungen ein- bis mehrmals pro Woche notwendig.