Allergien sind überschießende Reaktionen des Immunsystems auf Stoffe oder Substanzen, die normalerweise für den Organismus verträglich sein sollten. Allergisch reagieren kann man z. B. auf Pollen (Heuschnupfen), Milben (Hausstauballergie), Nahrungsmittel, synthetische Stoffe (z. B. Parfüm), Metalle (Nickelallergie) und vieles mehr. Besonders häufig sind Pollen- und Nahrungsmittelallergien.
Allergien können eine sofortige Reaktion des Organismus hervorrufen (Niesen, Augentränen, Luftnot) oder zeitverzögert Beschwerden verursachen. Gerade bei den Nahrungsmitteln trifft man häufig beide Reaktionsformen an. Vor allem die um mehrere Stunden bis Tage verzögert auftretenden Symptome sind oft unspezifisch (z. B. Bauchschmerzen, Hautausschläge, Kopfschmerzen) und lassen sich daher für den Patienten den einzelnen Nahrungsmitteln meist nicht zuordnen.
Eine wesentliche Rolle in der Entstehung und Aufrechterhaltung von Allergien spielen die chronisch maskierten Allergien auf Weizen- und Kuhmilchprotein, die dem Patienten meist nicht bewusst sind. Die Behandlung dieser beiden zentralen Allergien kann die Allergiebereitschaft des Organismus deutlich reduzieren. Das ist vor allem für Multiallergiker von wesentlicher Bedeutung, da die klassische Allergiebehandlung (Hyposensibilisierung gegen Einzelsubstanzen) auf Grund der Vielzahl von Allergien hier oft nicht greift.
Daneben gibt es auch Hinweise darauf, dass die Infektion mit bestimmten Viren bei der Ausbildung von Allergien von Bedeutung sein kann. Auch hier kann eine entsprechende Diagnostik und Therapie der Virusbelastung das Endergebnis einer Allergiebehandlung positiv beeinflussen.